動畫變形小雷第三季全集講述五年前，一次在大氣層中的爆炸釋放了納米機器人。感染了地球上的每一個生物。這些納米機器人能隨機改變了生物自身結構。變異成為變種人系列。為了保護地球和被納米機器人控制的生物，成立“天命”組織。 小雷原本只是普通的青少年，他也一樣感染納米機器人。但與別人不同的是，他不僅不被納米機器人控制，反而還能自己控制納米機器人。有了這樣的超能力，他在 “天命”組織的006的幫助下。阻止變種人的破壞，保護被納米機器人控制的人。